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產品關鍵詞:深圳病毒序列測序分析方法,病毒全基因組測序
***更新:2020-12-30 13:33:36
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詳細說明
在的鑒定及診斷中,通過高通量測序技術和RT-PCR方法的聯合使用,可以實現優勢互補,提高陽性檢出率。更為重要的是,利用高通量測序技術還可以對病毒序列進行組裝,獲得病毒全長基因組信息,為監測病毒變異、探究致病機理提供研究基礎。本次報告將圍繞高通量測序技術在**檢測中的方法和策略展開分享。高通量測序技術的飛速發展使其在病毒學研究領域得到了越來越普遍的應用,深圳病毒序列測序分析方法。無論是突發**的應急處理、新病毒的發現,還是較大規模的分子流行病調查,深圳病毒序列測序分析方法,深圳病毒序列測序分析方法,高通量測序技術都比一代測序技術有著巨大的優勢。SFTS病毒(SFTSvirus,SFTSV)是2009年在中國新發現的一種布尼亞科白蛉病毒屬的蜱傳病毒,為新發傳染病發熱伴血小板減少綜合征(Severe fever with thrombocytopenia syndrome,SFTS)致病病因,現在在中國至少20個省流行。探普生物對病毒的全基因組進行測序的實驗基于二代測序技術。深圳病毒序列測序分析方法
在哪些應用場景需要對病毒的全基因組進行測序?在探普生物長時間運行過程中,我們接觸到的對病毒的全基因組進行測序項目有比較豐富的應用場景。先,從事基因進化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監測某幾個關鍵基因,搭載一定頻率的全基因組測序。這樣的組合省時省力省經費,同時能達到研究目的。此外,有的單位需要對傳染病的病原進行流行病學監測和研究,如疾控/疫控中心、醫院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應課題組,可能需要對病毒的全基因組進行測序以后,結合其他上下游的研究數據,達到研究或者監測疫病的目的。深圳病毒序列測序分析方法病毒全基因組測序產品特點:整體檢出率陽性率較傳統方法提升25~30%。
新一代測序中,基因從頭測序和重測序有什么區別?我要做乙肝病毒DNA全長測序,應該選用哪種方法?1、條件不同;從頭測序的條件是不依賴于任何物種基因組;重測序的條件是在已知物種基因組的情況下進行的。2、病毒變異率不同;從頭測序是通過拼接和組裝的方式獲得基因組序列圖譜,病毒變異率很低;重測序可以尋找出大量的單核苷酸多態性位點,插入缺失位點,結構變異位點,拷貝數變異等變異信息,從而獲得生物群體的遺傳特征。病毒變異率很高。乙肝病毒在醫學上已經測過,只需要做重測序就可以。
測序深度,測序得到的堿基總量(bp)與基因組大小(Genome)的比值,它是評價測序量的指標之一。測序深度(Sequencing Depth):測序得到的堿基總量(bp)與基因組大小(Genome)的比值,它是評價測序量的指標之一。測序深度與基因組覆蓋度之間是一個正相關的關系,測序帶來的錯誤率或假陽性結果會隨著測序深度的提升而下降。重測序的個體,如果采用的是雙末端或Mate-Pair方案,當測序深度在10~15X以上時,基因組覆蓋度和測序錯誤率控制均得以保證。比較基因組學層面可通過差異分析、同源基因分析、共線性分析、物種進化分析等手段探究病毒的毒力系統。
深度測序技術對社會的影響:深度測序技術促進了基因檢測的普及,對社會的影響第1個方面反映在商業模式的變化,即醫學檢驗和健康管理方面的平民化、個性化趨勢的形成。社會生活受到深度測序技術影響的第二個方面是基因測序的普遍應用。例如,基因關聯將人與人通過遺傳學關聯起來,人們可以對基因進行分析判定親緣關系,基因測定甚至可以幫助判定婚姻(包括遺傳病等方面的)匹配度。公安機關可以通過基因比對,鎖定犯罪嫌疑人、尋找丟散的兒童和親人。甚至有報道表明,測定20多個基因就可以將人臉重構。基因檢測的應用將隨著基因-表型的關聯得到更普遍的應用,對社會生活的方方面面起到重要作用。病毒的全基因組測序以及對應的生物信息學分析方法是研究病毒進化、毒力因子變異、疫病爆發之間的關系。成都病毒全序列服務公司
全基因組測序覆蓋面廣,能檢測個體基因組中的全部遺傳信息,準確性高。深圳病毒序列測序分析方法
病毒全基因組測序產品特點:1.不預設目標檢出物,樣本的所有病原信息一網打盡;2.無需培養和特異性擴增,對采集臨床樣本直接檢測;3.獨有的一定定量技術,實現病原定量分析,使病原診斷更準確;4.與臨床各領域****共同打造呼吸道系統、神經內科系統和血流系統傳染病原數據庫,更加貼合需求;5.采用高通量測序儀,全流程質控, 結果穩定可靠;6.整體檢出率陽性率較傳統方法提升25~30%:肺泡灌洗液檢出率60~80%,腦脊液檢出率40~60%,血液檢出率40~60%;7.專業化服務:臨床微生物**出具報告,專業醫學團隊報告解讀。針對疑難報告,由****進行深度解析 ;8.完善的售后服務:基于PCR技術和抗原抗體技術的售后驗證平臺,致力于解決臨床的每一個疑問。深圳病毒序列測序分析方法
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