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產品關鍵詞:河南宏基因組測序分析,病毒宏基因組測序
***更新:2020-12-30 13:33:36
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詳細說明
對樣本進行宏病毒組測序有什么意義?和細菌的宏基因組相似,病毒宏基因組也是旨在研究微生物群體中的物種分布規律和差異,通過大數據分析微生物群體的功能。通過對樣本進行宏病毒組測序,我們可以了解單個樣本里有什么病毒,相對含量是多少,優勢物種是什么;還可以了解不同群體間物種分布有何差異,結合樣本來源和其所屬環境,河南宏基因組測序分析,河南宏基因組測序分析,指導下游的實驗方向。于科研,好的群體和樣本可以發表質量的學術論文;于臨床,可以輔助臨床醫生進行微生物侵染類疾病診斷并在一定程度提供用藥指導。隨著數據庫日趨完善,對樣本進行宏病毒組測序以后,河南宏基因組測序分析,我們將獲得越來越豐富的信息,它有朝一日會成為研究者非常常規的研究手段。病毒宏基因組學是宏基因組學的一個分支,指研究特定環境中的病毒群落的一門技術。河南宏基因組測序分析
在探普生物進行病毒宏基因組測序的流程非常簡單,簡而言之,客戶只需要說清楚樣品情況,準備樣品即可,其他事宜都由探普來進行安排。大致流程如下:1)與銷售人員溝通項目需求和樣本情況;2)探普生物工作人員擬定項目合同,雙方協商合同內容后簽字蓋章;3)按樣本準備指南準備好樣本,填寫信息單后通知銷售人員預訂干冰,安排樣本寄運輸;4)客戶支付項目啟動款,探普生物啟動項目實驗和分析并提供測序報告;5)客戶支付項目尾款,探普生物提交測序數據和分析結果;6)售后問題處理,項目結題。北京宏病毒組分析目前,構建的病毒宏基因組學文庫主要有載體克隆文庫和基于高通量測序技術的加接頭的文庫。
病毒宏基因組測序又稱宏病毒組(Virome),是在宏基因組學理論的基礎上,結合現有的病毒分子生物學檢測技術而興起的一個新的學科分支。而所謂宏基因組學(metagenomics)就是一種以環境樣品中的微生物群體基因組為研究對象,以功能基因篩選和測序分析為研究手段,以微生物多樣性、種群結構、進化關系、功能活性、相互協作關系及與環境之間的關系為研究目的的新的微生物研究方法。一般包括從環境樣品中提取基因組DNA,克隆DNA到合適的載體,導入宿主菌體,篩選目的轉化子等工作。
DNA宏基因組測序的病原檢出率均高于培養等傳統方法,表現出良好的診斷性能。DNA宏基因組測序已被用于診斷各種臨床傳染性疾病,例如血液傳染,肺和肺外結核(TB),侵襲性傳染,寄生蟲傳染,傳染性心內膜炎,復雜性肺炎,尿路傳染和實體移植后的繼發傳染等,為臨床傳染性疾病的診斷和提供了新的前景。盡管一項多中心的回顧性研究表明,目前使用mcfDNA宏基因組測序作為診斷常見傳染疾病的工具的優勢并不明顯,但它可以提供比傳統方法更快、更早的診斷結果,以及在的升級/降級方面具有重要意義。對樣本進行宏病毒組測序于科研,好的群體和樣本可以發表質量的學術論文。
在運用宏基因組測序方法檢測的樣本量位居全球前列,樣本總數居國內第二,其中腦脊液檢測量位列全球前二強。除了傳染病的應用場景之外,利用mNGS還可以對菌群進行菌株鑒定分型、耐藥基因與毒力基因的檢測,適用于抗傳染院內傳染管理的評估。在越來越多的證據表明微生物對人體免疫系統能夠產生影響,以及微生物菌群會參與到神經退行性疾病、糖尿病等疾病的發生和發展當中,微生物療法獲得了越來越多的關注,而mNGS未來也可以為人們深入分析人體菌群微生態、研究微生物療法提供一種可靠的技術手段。探普生物對樣本進行宏病毒組測序實驗基于二代測序技術。成都微生物多樣性測序分析排行
和細菌的宏基因組相似,病毒宏基因組也是旨在研究微生物群體中的物種分布規律和差異。河南宏基因組測序分析
病毒宏基因組測序研究案例:噬菌體是糞便病毒組的主要成員,糞便病毒組移植(FVT)或能有效的調節腸道菌群。在該項概念驗證試驗中發現,接受瘦小鼠的糞便病毒組移植后,飼喂高脂食物的小鼠體重增長變慢,同時還能保持正常的血糖指標,FVT引起的腸道菌群變化介導了這些保護性功能代謝作用。這項研究表明,FVT療法或能用來改善肥胖和糖尿病等腸道菌群相關代謝類疾病。對噬菌體不造成損傷,大程度保證了病毒活性,適用于下游FVT研究。宏病毒組學(ViralMetagenomics)是宏基因組學的一個分支,但與傳統的宏基因組學概念不同,它是在宏基因組學概念的基礎上,結合病毒自身的特點,將宏基因組學方法應用到病毒學領域而形成的。河南宏基因組測序分析
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